Alors qu'il est tombé malade, Conan reçoit un coup de fil de Aï qui l'informe qu'elle a trouvé un nouvel antidote pour l'APTX4869. Conan se rend de toute urgence chez le professeur. Il est très faible et malgré les conseils de Aï, il ingère quand même le médicament. Lorsqu'il se réveille, il croit avoir retrouvé son corps. Mais il se retrouve propulsé 10 ans dans le futur, là-bas il apprend que Conan est au lycée et que Ran a été demandé en mariage par un professeur. Il apprend aussi que cela fait 10 ans que Ran attend Shinichi. Ran va-t-elle épousé le professeur ? Et Conan réussira-t-il à retourner à son époque ?